Начну с ДНК-микрочипов.
Микрочип – это такая штука для генетических исследований. Сейчас микрочипы находятся на пике своей популярности. С одной стороны это достаточно передовая технология. С другой стороны один уже долго на рынке (10 лет), с их помощью раздобыли много данных, про них опубликовано много статей, и уже даже грозятся, что они устаревают.
Вид микрочипа зависит от фирмы производителя. Те, с которыми мы работали, выглядят так:
Каждая штуковина стоит порядка 700 евро. И, да, они одноразовые.
Теперь про то, как оно работает.
Представьте себе лакмусовую бумажку. Лакмусовая бумажка приобретает специфический цвет, если поместить ее в особые химические условия. А теперь представьте лакмусовую бумажку, которая вместо щелочи/кислоты реагирует на присутствие в растворе ДНК какого-нибудь определенного гена. Теперь возьмите несколько таких бумажек (по одной на каждый ген), и поместите их рядышком на стеклышко. Вы получите ДНК-чип. Если на него капнуть раствором ДНК, то можно проверить наличие сразу нескольких генов одновременно. Если же взять несколько тысяч таких бумажек и уменьшить их в несколько тысяч раз (невооруженным взглядом их уже не разглядеть, нужен микроскоп) то получится ДНК микрочип*
Основное преимущество технологии – высокий параллелизм. За один проход можно измерить в клетке активность сразу нескольких тысяч генов.
В лаборатории процесс использования микрочипа выглядит примерно следующим образом: Сначала берут образец (например, ткань из раковой опухоли), добавляют в него всякие возможные химикалии, очищают, нагревают, крутят на центрифуге и трясут на машинке-трясучке. И так несколько дней. Наконец образец специальным образом подкрашивают и наносят на микрочип (в случае микрочипа с картинки – образец впрыскивают внутри с помощью шприца). Микрочип день лежит, производит свои реакции, затем его сканируют с помощью специального сканера в ультрафиолетовом свете. Теперь микрочип можно выкинуть.
По завершению эксперимента остается такая картинка:
Тут то и нужны биоинформатики – они анализируют полученные данные (а количество производимых от одного подобного эксперимента данных огромно - сразу несколько гигабайт), и выделяют из них полезную информацию. Если повезет, конечно. Например, сравнивают подобную картинку, оставленную здоровой клеткой с картинкой от раковой опухоли и ищут гены ответственные за образование рака.
Напоминает поиск преступника по базе отпечатков пальцев.
Интересное замечание – на микрочипах с картинки стоит надпись «только для исследовательских целей». Это значит их нельзя использовать в медицине, диагностике или судмедэкспертизе. Дело не в том, что микрочипы принципиально для этого не подходят, а в том, что фирма-производитель не хочет брать на себя возможную ответственность за врачебные ошибки.
*на самом деле все конечно намного сложнее и совсем по-другому.
Комментариев нет:
Отправить комментарий